一是重大传染病救治能力提升工程。省级建2所传染病医院，16个州市和4个人口超过80万的县市区建设非独立传染病医院，其他县市区在县级医院改扩建感染性疾病科。二是疾控机构核心能力提升工程。建设高水平的“区域性国际疾病预防控制中心”，至少5个实验室成为世界卫生组织网络实验室，建立云南巴斯德传染病研究联合实验室；建设6个省级区域性疾控中心和20个县级国门疾控中心。